5.4.2. Еукариотни микроорганизми

Еукариотните клетки се различават от прокариотните по своята комплексна структура: те притежават добре развито ядро.

Процесите на генен трансфер при тези микроорганизми (дрожди и филаментозни гъби) също се различават от тези, описани при бактериите.

Естествената клетъчна хибридизация и генетична рекомбинация се срещат главно при видове, притежаващи полов или парасексуален клетъчен цикъл. Тези събития се осъществяват в еукариотни клетки с полово размножаване посредством мейтинг, мейоза и спорулиране. Генният трансфер при микроорганизмите с парасексуален жизнен цикъл протича чрез анастомоза, ядрено сливане и хаплоидизация чрез постепенна загуба на хромозоми. При някои родове може да се наблюдава и междувидова хибридизация между близкородствени видове.

Транферът на синтетични гени от дрожди към клетки на бозайници е осъществен чрез дрождеви изкуствени хромозоми (YAC). Те са с изключителен потенциал, като вектори при генната терапия.